Впервые в российской ветеринарной практике для диагностики грибковых инфекций применен метод метагеномного секвенирования

Лаборатория микологии ФНЦ ВИЭВ совместно с коллабораторами провела пилотное диагностическое исследование клинического материала от животных методом таргентного метагеномного секвенирования по ITS-региону (микологическое профилирование). Объект исследования — клинический материал из кожных поражений дикого пушного животного. Цель исследования — метагеномная детекция грибов как возможных этиологических агентов вспышки дерматоза в популяции.
В результате метагеномного микологического исследования в первом образце материала обнаружено 249 грибных таксономических единиц, в то время как при стандартном микологическом посеве обычно выделяется не более 5 видов. Для каждого вида дана количественная оценка содержания. Что особенно интересно — выявлена целая ассоциация потенциально патогенных грибов (родов Chrysosporium, Arthroderma, Malassezia). При микологическом посеве, ни один из этих грибов не был обнаружен, при обильном росте быстрорастущих «плесневых» культур.
Хотя данный метод дорогостоящий, и требует дальнейшего оттачивания, полученные предварительные результаты говорят об огромных возможностях применения метагеномного секвенирования для диагностики инфекционных (в т.ч. грибковых) заболеваний.